Ciljevi HDBIMF-a su:

• stručno i znanstveno povezivanje stručnjaka koji se bave biomedicinskim inženjerstvom i medicinskom fizikom,
• unapređivanje i promicanje područja biomedicinskog inženjerstva i medicinske fizike,
• poticanje edukacije iz područja biomedicinskog inženjerstva i medicinske fizike,
• poticanja znanstvene aktivnosti iz područja biomedicinskog inženjerstva i medicinske fizike,
• poticanje stvaranja i razvoja tehničke regulative iz područja biomedicinskog inženjerstva i medicinske fizike,
• unapređivanje društvenog položaja stručnjaka u području biomedicinskog inženjerstva i medicinske fizike.